敦睦艦隊截至昨（21日）已有27人確診，讓外界質疑是不是政府溝通不良造成防疫破洞，甚至傳出有部會因為指揮中心非一級開設，因此不一定聽從中央流行疫情指揮中心命令。指揮官陳時中21日針對針對媒體詢問「外界質疑政府溝通出問題」、「有部會不聽中心指揮」回應，「好像大家都不喜歡我這個指揮官」，讓他感覺「有點傷心。」
陳時中表示，敦睦艦隊官兵感染事件上演後，指揮中心已經列出700多名接觸者，數量讓地方政府也相當焦慮，至於最初的感染源頭來自何處，目前正回溯找出是否有無症狀感染者，未來獲得更多訊息後，希望以較科學的方式釐清感染源。對於是否進行普篩，陳時中表示，有待與相關專家討論，因為社區裡沒有感染源，假設船上的人都沒問題，在封閉環境中並不會突然生出病毒，像先前做的蒼蠅實驗，「沒有來源的話」不會生出相關病菌，所以還要搜集更多資訊，將依各種證據隨時做出政策改變。
敦睦艦隊700多人遍及全台各地，讓民眾擔憂是否引發社區感染．指揮中心指出，日前已規劃3階段「阻絕社區傳染」整備方案，分為第一階段過渡期、第二階段警戒期、第三階段管制期（封城），過渡期是指社區若有未明感染源，將針對公共場所加強查核，台灣目前在第一、二階段之間。由於人口密度不同，已訂相關準則和各部會商討，之後將交給地方政府研擬最適合的做法。
4/21疫情指揮中心記者會：
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